Seorang ilmuwan berhasil melakukan persilangan DNA antara serangga dengan DNA seseorang yang bernama Kazamatsuri Shin. Persilangan tersebut akhirnya berhasil maka jadilah Shin Kazamatsuri menjadi Kamen Rider Shin.

Kelompok jahat bernama The Foundation akan menguasai dunia. Namun pada akhirnya Kamen RIder Shin dapat mengalahkannya beserta android jahat yang diperintahkan untuk membunuhnya.